Bilimde 'dönüm noktası': Yapay zeka ile sıfırdan virüs üretildi

Bu görsel, bir bakteriyofajın bilimsel bir illüstrasyonudur. Bakteriyofaj, geometrik bir başa, segmentli bir kuyruğa ve tabanından uzanan çok sayıda ince bacak benzeri yapıya sahip olarak gri tüylü bir yüzeye konarken gösterilmiştir. Virüs, gri arka plandan belirgin bir şekilde öne çıkan parlak kırmızı renkte gösterilmiştir.

Kaynak, Getty Images

Fotoğraf altı yazısı, Yapay zeka modelleri virüslerden, bakterilerden, bitkilerden ve insanlardan elde edilen genetik kodlar üzerinde eğitildi.
    • Yazan, James Gallagher
    • Unvan, Sağlık ve bilim muhabiri
  • Yayın tarihi
  • Okuma süresi 5 dk

ABD'de bir grup araştırmacı, yapay zeka ile tamamen işlevsel ve laboratuvarda çoğalabilen yepyeni virüsler tasarladıklarını duyurdu.

Bir organizmanın tüm genom haritasının yapay zeka ile tasarlanması ilk kez gerçekleşiyor.

Üretilen 16 yeni virüsün bakterileri enfekte etmek üzere tasarlandığı, insanlara tehdit oluşturmadığı vurgulandı.

Araştırmacılar gelinen noktayı, hastalıkların tedavisinde yeni bir dönemin kapısını açabilecek, "çok önemli bir bilimsel dönüm noktası" olarak nitelendirdi.

Bununla birlikte uzmanlar, yapay zeka tasarımı virüslerin güvenlik endişeleri yarattığı konusunda da uyardı.

Yapay zeka halihazırda yeni antibiyotiklerin tasarlanmasında kullanılıyor.

Ancak bu, sıfırdan yeni ve işlevsel bir virüs tasarlamaya kıyasla nispeten daha basit bir işlem.

BBC'ye konuşan Stanford Üniversitesi'nden yardımcı doçent Brian Hie, üretken yapay zekanın, "ilk kez eksiksiz bir genom tasarlamak için" kullanıldığını söyledi.

Bu araştırmacıların kullandığı teknoloji ChatGPT gibi büyük dil modellerine benzer şekilde çalışıyor.

Bu örnekte, Evo1 ve Evo2 olarak bilinen yapay zeka modelleri, metin dizileri yerine yaşamın dilini tahmin ediyor.

Kullandıkları yapay zeka modelleri, virüslerden, bakterilerden, bitkilerden ve insanlardan alınan genetik kodlar üzerinde eğitildi.

Daha sonra bu virüsler, yalnızca belirli bakteri türlerini enfekte eden bakteriyofaj adı verilen bir virüs türü üretmek üzere rafine edildi.

Bir laboratuvar veya araştırma ofisi ortamı gibi görünen bir yerde, bir masada birlikte çalışan iki kişi. Büyük bilgisayar monitörlerinde koyu arka planlar üzerinde renkli üç boyutlu moleküler veya protein yapı modelleri görüntülenirken, masadaki bir dizüstü bilgisayarda kod satırları veya veriler gösteriliyor. Bir kişi dizüstü bilgisayarı kullanarak oturuyor, diğeri ise ekranlara doğru eğiliyor ve her ikisi de bilimsel görselleştirmelere odaklanıyor. Arka planda laboratuvar rafları ve ekipmanları görünüyor, bu da biyomedikal, biyoteknoloji veya hesaplamalı araştırma ortamını düşündürüyor. Sahne, karmaşık biyolojik yapıları incelemek için bilgisayar tabanlı analiz ve görselleştirme araçlarının kullanımını vurguluyor.

Kaynak, Stanford University

Fotoğraf altı yazısı, Fotoğrafta solda bir meslektaşıyla birlikte görülen yardımcı doçent Brian Hie, çalışması hakkında "Bu bizim için yeni bir alandı" dedi.

Stanford Üniversitesi'nden araştırmacılar, en fazla umut vadeden 302 yapay zeka tasarımını seçti ve bunları laboratuvarda sentezledi.

Bunlardan 16'sı koli basili bakterilerini öldürmede etkili oldu.

Bu laboratuvarda doktora öğrencisi olan Samuel King, bakteriyofajın etkili olduğunu günün erken saatlerinde çalışırken fark ettiklerini söyledi.

Araştırmacılar, yapay zeka tasarımı bakteriyofajı, üzerinde bakteri tabakası oluşmuş kültür kaplarına aktardı.

King sonrasını, "Berrak noktalar görmeye başlamıştık ve bu son derece heyecan vericiydi" diyerek anlattı.

Brian Hie de sonuçların ekiple paylaşıldığı anı, "oda bir anda alkış tufanıyla inledi" diye hatırlıyor.

Yeni bakteriyofaj geliştirilmesi, antibiyotiklere dirençli hale gelen enfeksiyonların tedavisinde yeni yöntemlere yol açabilir.

Bu görsel, bir bakteriyofajın bilimsel bir illüstrasyonudur. Bakteriyofaj, geometrik bir başa, segmentli bir kuyruğa ve tabanından uzanan çok sayıda ince bacak benzeri yapıya sahip, dokulu bir yüzeyin üzerinde yüzer halde gösterilmiştir. Virüs, koyu mavi arka planla keskin bir kontrast oluşturan parlak kırmızı, turuncu ve pembe tonlarda resmedilmiştir. Sahne boyunca dağılmış küçük, odak dışı parçacıklar, mikroskobik bir ortam izlenimi yaratmaktadır. Kompozisyon, bakteriyofajın alışılmadık şeklini ve stilize edilmiş, büyütülmüş bir biyolojik ortam içindeki izolasyonunu vurgulamaktadır.

Kaynak, Getty Images

Fotoğraf altı yazısı, Faj terapisi, antibiyotiklerle tedavi edilemeyen ve giderek artan bakteriyel enfeksiyon vakalarına potansiyel bir çözüm olarak görülmektedir.

Ancak bu bilimsel atılım aynı zamanda yapay zekanın doğa üretimi olmayan biyoloji tasarlayabilme kapasitesine de işaret etti. Bu da sentetik biyoloji olarak biliniyor.

Araştırmacı Hie, bunun yeni ilaç ve tedavilerle "insan sağlığını büyük ölçüde iyileştirme" potansiyeline sahip olduğunu savundu.

Buna karşın aynı teknolojinin kötü amaçlarla yeni hastalıklar yaratmak için kullanılabileceğine dair endişeler de dile getiriliyor.

Johns Hopkins Üniversitesi Sağlık Güvenliği Merkezi'nden Dr. Thomas Inglesby ve Dr. Moritz Hanke, Science dergisinde yayınlanan araştırmanın bulgularının "acil biyolojik güvenlik ve biyolojik emniyet sorularını" gündeme getirdiğini yazdı.

"Artık mesele, üretken virüs genom tasarımının var olup olmayacağı değil, ciddi zarara yol açmadan kullanılıp kullanılamayacağı meselesi" uyarısı yaptılar.

Inglesby ve Hanke, hastalık yapma potansiyeli olan yeni virüslerin "peşinden gidilmemesi" gerektiğini de vurguladı.

Araştırmacılar, güvenliği en üst düzeye çıkarmak için gerekli adımları attıklarını açıkladı.

Bunu yaparken karmaşık organizmaları enfekte edebilecek virüsleri eğitim veri tabanından çıkardılar.

İnsanları enfekte eden virüsler yerine fajlar üzerinde araştırma yaptılar ve tüm çalışmalar güvenli bir laboratuvarda gerçekleştirildi.

Hie, mevcut güvenlik önlemlerinin bile "teknolojinin iyi amaçlar için kullanılmasını sağlamada" büyük ölçüde katkı sağladığını savunuyor.

Bilgisayar bitlerinden atomlara

Virüsler bilimsel anlamda canlı olarak sayılmıyor.

Bu nedenle şu an için yapay zekanın canlı organizmalar üretebilmesi için önemli bir bilimsel atılım daha gerekli.

Bir fajın genetik kodu yaklaşık 5400 baz çifti (harf) uzunluğunda.

Canlı bir hücreninse en küçük genomu yaklaşık 500.000 baz çifti uzunluğunda.

İnsan genomu ise üç milyar baz çiftidir.

Araştırmacı Hie, basit organizma üretimini denemenin "muhtemelen çok fazla iş gerektireceğini, ancak imkansız olmadığını" ve bu yönde çalışmaya "kesinlikle ilgi duyduklarını" söyledi.

Bu görüntüde, geniş pencereleri ve doğal ışığı olan aydınlık bir ofis veya araştırma ortamında bir masada çalışan iki kişi görülmektedir. Bir kişi çift monitörlü bir çalışma istasyonunun önünde otururken, diğeri yakında durarak ekranlardan birinde görüntülenen ayrıntılı bir moleküler veya protein yapısını işaret etmektedir. Monitörlerde bilimsel görselleştirme yazılımı gösterilmektedir; bir ekranda karmaşık üç boyutlu bir biyolojik model, diğerinde ise metin veya veri bulunmaktadır. Çalışma alanının etrafında su şişesi, kupa, bilgisayar çevre birimleri ve saksı bitkileri gibi çeşitli masa eşyaları görülebilmektedir.

Kaynak, Stanford University

İspanya'daki Pompeu Fabra Üniversitesi sentetik biyoloji laboratuvarından Prof. Marc Güell, çalışmanın "çok önemli bir dönüm noktası" olduğunu, çünkü "tarihte ilk kez biyolojinin bilgisayar üzerinden tasarlanmaya başladığını" söyledi.

"Bu, insanlığın en büyük zorluklarının üstesinden gelmek için heyecan verici olasılıkları hayal etmemize olanak tanıyor" dedi.

Bunlar arasında hastalıklarla mücadele etmek için fajlar geliştirmek, genetik bozuklukları tedavi etmek için enzimler ve immünoterapide kullanılabilecek antikorlar yer alıyor.

Manchester Biyoteknoloji Enstitüsü'nde sentetik genomik bölüm başkanı olan Prof. Patrick Cai, çalışmanın "önemli bir dönüm noktası" olduğuna katıldı.

"Bu durumun önemi fajların çok ötesine uzanıyor; genom dili modellerinin evrim tarafından kodlanan tasarım prensiplerini öğrenmeye başladığını ve yapay zeka destekli genom yazımının önünü açtığını gösteriyor" dedi.

Orijinali İngilizce olan bu makalenin çevirisinde yapay zekadan yararlandık. Yayınlanmadan önce çeviriyi bir BBC gazetecisi kontrol etti. Yapay zekayı nasıl kullandığımız hakkında daha fazla bilgi burada.